Shigella spp e coli eiec днк что это
Молекулярно-генетический анализ, который позволяет обнаружить генетический материал возбудителей шигеллеза и эшерихиоза в кале.
Шигеллы и энтероизвазивные кишечные палочки (ЭИКП) (эшерихии, колибактерии), возбудители шигеллеза (бактериальной дизентерии) и эшерихиоза.
Синонимы английские
Shigella species and enteroinvasive Esherichia coli (EIEC), DNA, PCR, fecal samples.
Полимеразная цепная реакция в режиме реального времени.
Какой биоматериал можно использовать для исследования?
Как правильно подготовиться к исследованию?
Общая информация об исследовании
Shigellaspeciesи Esherichiacoli– грамотрицательные палочковидные микроорганизмы из семейства энтеробактерий. В норме шигеллы и энтероинвазивные кишечные палочки (ЭИКП) отсутствуют в организме. Их выявление указывает на кишечную инфекцию, которая требует лечения пациента и ограничения распространения заболевания.
К роду Shigella относятся патогенные бактерии S. dysenteriae, S. flexneri, S. boydii и S. sonnei, которые являются возбудителями шигеллеза (бактериальной дизентерии).
Бактерии рода E. coli различаются между собой по биохимическим и патогенным свойствам. Не все E. coli, а только некоторые биовары и серотипы колибактерий способны вызывать эшерихиоз. Типичные колибактерии являются представителями нормальной микробиоты кишечника человека, участвуют в процессах пищеварения и относятся к условно-патогенной среде. Кишечные палочки, которые синтезируют и выделяют шигеллоподобный токсин, способствуют развитию эшерихиоза, который протекает по типу инвазивной острой кишечной инфекции (дизентерии). ЭИКП, так же как и шигеллы, могут проникать в клетки слизистой кишечника и разрушать энтероциты, что приводит к образованию язвенных дефектов в слизистой кишечника.
Шигеллы и кишечные палочки распространяются фекально-оральным механизмом передачи, который реализуется пищевым, водным и контактно-бытовым путями.
Инкубационный период составляет от нескольких часов до нескольких дней и зависит от количества бактерий, их патогенных свойств и особенностей защитных механизмов человека. Заболевание может протекать как в легких формах со стертой симптоматикой, так и с развитием тяжелой инфекции. Признаки шигеллеза и энтероинвазивного эшерихиоза схожи: острое начало, резкая боль в животе, многократный стул с примесью слизи и крови, спазм сигмовидной кишки, общая интоксикация.
Около 8 % случаев инвазивного эшерихиоза приводит к гемолитико-уремическому синдрому, который проявляется острой почечной недостаточностью, гемолитической анемией, тромбоцитопенией и пурпурой.
После выздоровления возможно длительное выделение бактерий с калом (характерно для шигеллеза), что способствует распространению инфекции.
Необходимо также учитывать, что существует несколько патологических состояний и кишечных инфекций, которые сопровождаются вышеуказанной симптоматикой, но лечатся по-разному. При обследовании пациента с кровавой диареей необходимо в первую очередь исключить шигеллез, эшерихиоз, амебиаз, отравление химическими веществами, язвенный колит, болезнь Крона, острую кишечную непроходимость и тромбоз сосудов брыжейки.
Для выявления и дифференциальной диагностики кишечных инфекций используются культуральные и молекулярно-генетические методы исследования генетического материала возбудителя в кале и определение концентрации специфических иммуноглобулинов в крови. ПЦР обладает преимуществом перед культуральным методом благодаря быстрому получению результатов и высокой специфичности и чувствительности исследования. Быстрая диагностика острых кишечных инфекций позволяет избежать лишних инвазивных процедур и оперативных вмешательств, своевременно начать лечение и ограничить очаг распространения инфекции.
Для чего используется исследование?
Когда назначается исследование?
Что означают результаты?
Референсные значения: отрицательно.
Причины положительного результата:
Причины отрицательного результата:
Кто назначает исследование?
Инфекционист, гастроэнтеролог, терапевт.
Острые кишечные инфекции методом ПЦР, скрининг (Shigella spp., E. coli (EIEC), Salmonella spp., Campylobacter spp., Adenovirus F, Rotavirus A, Norovirus 2 генотип, Astrovirus)
Описание
Острые кишечные инфекции (ОКИ) – это целая группа заболеваний различной этиологии (бактерии, вирусы, простейшие), для которых характерен фекально-оральный механизм передачи. Источником заражения может быть пища, вода, грязные руки, инфицированные предметы быта. Для большинства ОКИ характерно довольно тяжелое течение с диареей, болью в животе, выраженной интоксикацией, особенно в детском возрасте.
Показания
Боли в животе, жидкий стул, урчание в животе (слышное на расстоянии), вздутие живота, боли вокруг пупка (усиливающиеся при дефекации), диарея. Исследование проводится для диагностики, а также дифференциальной диагностики острых форм кишечных инфекций, носительства, при обследовании контактных лиц, а также для оценки эффективности проведенного лечения.
Во время проведения скрининга идентифицируются:
Shigella spp. – грамотрицательные палочковидные микроорганизмы из семейства энтеробактерий. К роду Shigella относятся патогенные бактерии, которые являются возбудителями шигеллеза (бактериальной дизентерии).
E. coli (EIEC) – Escherichia coli, общепринятое сокращение E. сoli, (EIEC-энтеровазивные) очень близки с шигеллами, синтезируют и выделяют шигеллоподобный токсин, способны проникать в клетки слизистой кишечника и повреждать энтероциты, что приводит к образованию язвенных дефектов в слизистый кишечник.
Salmonella spp. – относятся к семейству энтеробактерий. Существует множество серовариантов Salmonella species, способных вызвать у человека инфекцию по типу гастроэнтероколита, может протекать в форме острой кишечной инфекции, тяжелой генерализированной инфекции или бессимптомного носительства. Диагноз ставится только после выделения возбудителя, в данном исследовании после обнаружения его ДНК.
Campylobacter spp. В настоящее время кампилобактер рассматривается как ведущая причина бактериального гастроэнтерита у населения во всем мире. Молекулярно-генетический анализ для определения группы кампилобактерий позволяет детектировать те виды кампилобактерий, которые имеют этиологическую связь с острой кишечной инфекцией.
Adenovirus F – Аденовирусы группы F причина частых случаев вирусного гастроэнтерита. Наиболее часто аденовирусная кишечная инфекция наблюдается у детей в возрасте до 2 лет, однако также могут болеть подростки и взрослые люди. Молекулярно-генетический анализ аденовируса группы F обладает высокой диагностической чувствительностью и специфичностью.
Rotavirus A – ротавирусы А возбудители острой инфекции, при которой поражаются органы желудочно-кишечного тракта, сопровождается диареей, из-за которой возникает риск обезвоживания, нарушения электролитного и кислотно-щелочного баланса. Чаще гастроэнтеритом заболевают дети до 3 лет, у которых ротавирус составляет до 50% всех зарегистрированных случаев кишечных инфекций.
Norovirus 2 генотип – наиболее частый возбудитель вспышек ОКИ небактериальной этиологии. Эта особенность связана с низкой инфицирующей дозой и высокой устойчивостью в окружающей среде. ПЦР является «золотым стандартом» в клинической диагностике норовирусных инфекций.
Astrovirus – возбудитель острой кишечной инфекции. Астровирусная инфекция в большей степени поражает детей до 7 лет, причем наиболее часто заболевание наблюдаются у детей до года.При атаке вирусом поражается эпителий кишечника и Пейеровы бляшки. При этом развивается энтерит, сопровождающийся поносом и обезвоживанием организма.
Подготовка
Исследование рекомендуется проводить до начала приема либо спустя 14 дней после приёма антибиотиков и других антибактериальных химиотерапевтических препаратов. Исключается прием слабительных препаратов, введение ректальных свечей, масел в течение 72 часов до сбора кала.
Сбор материала
Кал собирается после самопроизвольной дефекации в одноразовый пластиковый контейнер с герметичной крышкой и ложечкой-шпателем для отбора пробы. Следует избегать примеси к калу мочи и отделяемого половых органов.
Кал собирается в количестве не более 1/3 объёма контейнера, в объеме не менее 5 г (половина чайной ложки). Хранение при температуре +2+8 С. Материал необходимо доставить в медицинский офис в течение 24 часов.
Шигелла Флекснера 1-5 (п/кол) в Городец
Исследование на определение концентрации антител в крови к Shigella flexneri 1-5 серотипов с целью диагностики шигеллеза — бактериальной дизентерии.
Приём и исследование биоматериала
Когда нужно сдавать анализ Шигелла Флекснера 1-5 (п/кол)?
Подробное описание исследования
Шигеллез, или дизентерия, — это острая кишечная инфекция, которая сопровождается интоксикацией организма и поражением желудочного-кишечного тракта, преимущественно дистальных отелов толстого кишечника. Возбудитель заболевания — бактерии рода Shigella. По свойствам их разделяют на 4 группы (Флекснера/S. flexneri, Боуди/S. boydii, Дизентерии/S. dysenteriae, Зонне/S. sonnei), каждая из которых имеет несколько типов.
Источником инфекции является человек. Механизм передачи возбудителя — фекально-оральный. Бактерии попадают в организм с загрязненной пищей или водой в желудок, а затем поступают в тонкий и толстый кишечник, где проникают в клетки, выделяют токсин и вызывают воспаление, вплоть до образования язв на слизистой оболочке. Токсин действует на нервные окончания, вызывая спазмы и боли, а также на сосуды, приводя к расстройству кровообращения. Токсин обладает не только местным действием, но и общим — у человека развивается интоксикация.
Инкубационный период составляет 2-3 дня. Заболевание начинается с повышения температуры тела, слабости, вялости, тошноты, боли в нижней части живота. Стул становится частым, жидким, с примесью крови. Затем человек ощущает резкие, тянущие боли в нижней части живота и ректальной области, позывы на опорожнение кишечника с незначительным отделением в виде слизи и/или крови, а иногда и полным отсутствием отделяемого (так называемые ложные позывы на дефекацию, тенезмы). Также выделяют гастроэнтеритический вариант, который характеризуется более значимым поражением верхних отделов желудочно-кишечного тракта, сопровождается обильной рвотой и частым стулом в отсутствие тяжелого поражения толстой кишки.
Дизентерия может приобретать хроническое течение (более трех месяцев). Оно может быть непрерывным, когда симптомы прогрессируют с глубоким поражением органов желудочно-кишечного тракта. При этом не наблюдается выраженной интоксикации, но человека мучают постоянные боли в животе и диарея. При рецидивном течении заболевания периоды обострения чередуются с фазами ремиссии. Хроническое течение шигеллеза более характерно для людей со сниженным иммунитетом.
Также одна из форм болезни — бактерионосительство. Оно характеризуется отсутствием клинических признаков во время и за три месяца до обследования, при этом в кале обнаруживаются шигеллы.
Шигеллез может иметь неблагоприятные последствия, особенно для детей. После заражения шигеллой Флекснера в 2-4% случаев возможно развитие реактивного воспаления суставов (артрита), поражения глаз (конъюнктивита) и воспаления уретры (уретрита). Своевременное обнаружение и лечение шигеллеза позволяет избежать появления его осложнений.
Для диагностики дизентерии используют бактериологические методы (выделение возбудителя), ПЦР (определение ДНК) и серологические (определение антител в крови).
При попадании в организм бактерий против них образуются защитные антитела — иммуноглобулины. IgM вырабатываются в начале заболевания, а IgG — на более поздних стадиях. Определение антител в крови к шигеллам (серология) является вспомогательным методом диагностики, особенно показано в случае отрицательного результата бактериологического исследования, если сохраняются подозрения на шигеллез. Анализ позволяет выявить суммарные антитела обоих классов к шигелле Флекснера 1-5 серотипов. Данное исследование необходимо проводить в динамике, при этом первый анализ проводится, например, при поступлении в стационар (лучше всего с 5-го дня заболевания), а затем через 7–10 дней после первого исследования. Подтверждением диагноза служит нарастание титра (уровня) антител не менее чем в 4 раза.
Шигелла Флекснера 1-5 (п/кол) в Масы
Исследование на определение концентрации антител в крови к Shigella flexneri 1-5 серотипов с целью диагностики шигеллеза — бактериальной дизентерии.
Приём и исследование биоматериала
Когда нужно сдавать анализ Шигелла Флекснера 1-5 (п/кол)?
Подробное описание исследования
Шигеллез, или дизентерия, — это острая кишечная инфекция, которая сопровождается интоксикацией организма и поражением желудочного-кишечного тракта, преимущественно дистальных отелов толстого кишечника. Возбудитель заболевания — бактерии рода Shigella. По свойствам их разделяют на 4 группы (Флекснера/S. flexneri, Боуди/S. boydii, Дизентерии/S. dysenteriae, Зонне/S. sonnei), каждая из которых имеет несколько типов.
Источником инфекции является человек. Механизм передачи возбудителя — фекально-оральный. Бактерии попадают в организм с загрязненной пищей или водой в желудок, а затем поступают в тонкий и толстый кишечник, где проникают в клетки, выделяют токсин и вызывают воспаление, вплоть до образования язв на слизистой оболочке. Токсин действует на нервные окончания, вызывая спазмы и боли, а также на сосуды, приводя к расстройству кровообращения. Токсин обладает не только местным действием, но и общим — у человека развивается интоксикация.
Инкубационный период составляет 2-3 дня. Заболевание начинается с повышения температуры тела, слабости, вялости, тошноты, боли в нижней части живота. Стул становится частым, жидким, с примесью крови. Затем человек ощущает резкие, тянущие боли в нижней части живота и ректальной области, позывы на опорожнение кишечника с незначительным отделением в виде слизи и/или крови, а иногда и полным отсутствием отделяемого (так называемые ложные позывы на дефекацию, тенезмы). Также выделяют гастроэнтеритический вариант, который характеризуется более значимым поражением верхних отделов желудочно-кишечного тракта, сопровождается обильной рвотой и частым стулом в отсутствие тяжелого поражения толстой кишки.
Дизентерия может приобретать хроническое течение (более трех месяцев). Оно может быть непрерывным, когда симптомы прогрессируют с глубоким поражением органов желудочно-кишечного тракта. При этом не наблюдается выраженной интоксикации, но человека мучают постоянные боли в животе и диарея. При рецидивном течении заболевания периоды обострения чередуются с фазами ремиссии. Хроническое течение шигеллеза более характерно для людей со сниженным иммунитетом.
Также одна из форм болезни — бактерионосительство. Оно характеризуется отсутствием клинических признаков во время и за три месяца до обследования, при этом в кале обнаруживаются шигеллы.
Шигеллез может иметь неблагоприятные последствия, особенно для детей. После заражения шигеллой Флекснера в 2-4% случаев возможно развитие реактивного воспаления суставов (артрита), поражения глаз (конъюнктивита) и воспаления уретры (уретрита). Своевременное обнаружение и лечение шигеллеза позволяет избежать появления его осложнений.
Для диагностики дизентерии используют бактериологические методы (выделение возбудителя), ПЦР (определение ДНК) и серологические (определение антител в крови).
При попадании в организм бактерий против них образуются защитные антитела — иммуноглобулины. IgM вырабатываются в начале заболевания, а IgG — на более поздних стадиях. Определение антител в крови к шигеллам (серология) является вспомогательным методом диагностики, особенно показано в случае отрицательного результата бактериологического исследования, если сохраняются подозрения на шигеллез. Анализ позволяет выявить суммарные антитела обоих классов к шигелле Флекснера 1-5 серотипов. Данное исследование необходимо проводить в динамике, при этом первый анализ проводится, например, при поступлении в стационар (лучше всего с 5-го дня заболевания), а затем через 7–10 дней после первого исследования. Подтверждением диагноза служит нарастание титра (уровня) антител не менее чем в 4 раза.
Шигеллы, эшерихии, сальмонеллы, кампилобактерии, ДНК (Shigella spp., E. coli (EIEC), Salmonella spp., Campylobacter spp., ПЦР) кал, кач. в Москве
Анализ кала на Shigella spp., Salmonellaspp., Campylobacterspp., E.coli — это комплексное исследование для выявления самых частых причин диареи бактериального происхождения: сальмонеллеза, шигеллеза (дизентерии), кампилобактериоза, эшерихиоза (диз.группа).
Приём и исследование биоматериала
Когда нужно сдавать анализ Шигеллы, эшерихии, сальмонеллы, кампилобактерии, ДНК (Shigella spp., E. coli (EIEC), Salmonella spp., Campylobacter spp., ПЦР) кал, кач.?
Подробное описание исследования
Острые кишечные инфекции (ОКИ) — это группа инфекционных заболеваний, поражающих желудочно-кишечный тракт и проявляющихся схожими симптомами.
ОКИ могут быть вызваны бактериями, вирусами и простейшими.
Возбудители этих заболеваний устойчивы во внешней среде, могут долго сохраняться на предметах, в продуктах, в воде, и, при благоприятных условиях, размножаться там.
Механизм передачи большинства ОКИ — фекально-оральный. Попадание возбудителя может осуществляться контактно-бытовым путем из-за несоблюдения правил личной гигиены, а также водным и пищевым путем — купание в загрязненных водоемах, употребление воды из непроверенных источников и пищи, приготовленной с нарушением санитарных норм.
Часто возбудители могут передаваться воздушно-капельным путем. Этот путь служит основным для распространения вирусов, вызывающих ОКИ. Большинство ОКИ имеют схожие симптомы:
У каждой ОКИ имеются особенности течения, которые связаны со свойствами вызвавшего болезнь микроорганизма.
Шигеллез, или дизентерия, — это инфекционное заболевание, вызываемое бактериями рода Shigella, при котором поражается преимущественно толстый кишечник.
Род Shigella включает 4 вида: Shigelladisenteriae, Shigellaflexneri, Shigellaboydii, Shigellasonnei. Заражение происходит фекально-оральным путем от человека к человеку.
Для шигеллеза характерно:
Энтероинвазивная кишечная палочка E. coli (EIEC) является патогеном. Она служит причиной эшерихиоза —ОКИ, по клиническому течению схожей с шигеллезом. Аналогично шигеллам, E. coli (EIEC) проникает в стенки толстого кишечника, выделяет шигеллоподобный токсин и способствует образованию язв в слизистой оболочке кишки. Это приводит к общему недомоганию, болям в животе и появлению крови в кале. Источником энтероинвазивной кишечной палочки может быть человек или животное.
Сальмонеллез — одна из самых распространенных бактериальных ОКИ, вызываемая бактериями Salmonellaspp. Выделяют около 2500 разновидностей — серотипов — этих бактерий, но только 10–15 из них обусловливают основную заболеваемость в мире, к ним относятся: S. enteritidis (S. enterica), S.typhimurium, S. derby, S. newport, S. heidelberg, S. panama, S. london, S. infantis, S. anatum.
Сальмонеллы передаются человеку как от животных, так и других людей. Многие животные являются носителями этой бактерии, заражение чаще всего происходит через инфицированные продукты (мясо, яйца, молоко, кондитерские изделия), произведенные и хранящиеся с нарушением санитарных норм.
Человек может быть бессимптомным носителем инфекции, при этом выделять сальмонеллы и заражать окружающих.
Для сальмонеллеза характерно:
При заражении S.typhimurium развивается брюшной тиф. Отмечается увеличение размеров печени и селезенки, внутрибрюшных лимфатических узлов, может появляться мелкая сыпь на боковых поверхностях туловища, сгибательных поверхностях рук. Из-за выраженной интоксикации сознание больного человека затуманивается, отмечается бред.
В отличие от других ОКИ сальмонеллы могут преодолевать кишечный барьер и попадать в кровь. С током крови они поступают в другие органы и вызывают в них воспаление:
Одно из самых тяжелых последствий проникновения сальмонелл в кровоток — системное воспаление в организме, или сепсис.
Такие осложнения сальмонеллеза наблюдаются при тяжелом течении заболевания, у ослабленных людей, страдающих хроническими заболеваниями.
Кампилобактерии (Campylobacterspp.) широко распространены в природе, их носителями служат многие животные от крупного рогатого скота до кошек. Не все виды кампилобактерий вызывают ОКИ, большинство из них являются условно-патогенными.
С. jejuni, C. coli, C. lari, C. upsaliensis приводят к возникновению ОКИ. В отличие от других возбудителей кишечных болезней они передаются человеку только от животных через употребление зараженного мяса, молока при несоблюдении санитарных норм обращения с продуктами.
Для кампилобактериоза характерно:
Описаны случаи проникновения кампилобактера в кровоток сквозь барьер кишечника. Такая ситуация наблюдается у ослабленных людей, страдающих хроническими заболеваниями.
В этом случае кампилобактериоз может осложняться поражением печени, поджелудочной железы, сердца и других органов. Самыми грозными осложнениями являются инфекционно-токсический шок и прогрессирующий паралич (синдром Гийена-Барре), однако они отмечаются крайне редко.
В целом, проявления всех ОКИ очень похожи. Исходя лишь из симптомов болезни и оценки эпидемиологической ситуации, врач не всегда может точно определить возбудителя кишечной инфекции. В то же время, чем раньше определена причина ОКИ, тем раньше будет начато правильное лечение и лучше прогноз заболевания. Особенно критично раннее определение возбудителя ОКИ для детей до 3 лет. Обезвоживание у них наступает быстрее, чем у взрослых, и может привести к тяжелым последствиям.
Определение комплекса возбудителей ОКИ (Shigellaspp., E. coli, (EIEC), Salmonellaspp.,Campylobacterspp.) с помощью обнаружения генетического материала этих бактерий в кале методом ПЦР позволяет быстро провести дифференциальную диагностику ОКИ и назначить правильное лечение.
Преимущества этой методики перед другими состоит в высокой достоверности и скорости получения результата.
